サーバー停止作業のほう、滞りなく終了しました。 
お陰さまでMusicサーバー機能も取り込むことができ、完全なオールインワンサーバーが完成です。 
(追伸)
いやあ、調子がいいです。 マザーボードだけでなくメモリも16GBに一気に倍増させたこともあり、以前調子が悪かったUSBサウンドデバイスは一度もハングしません。 (今、DDR3のメモリはかなり安いので買い時です。)
なお、省エネのために、CPUのクロックを少し落としました。 若干、サイトの表示速度に影響がありますが、問題無い範囲だと思います。
先ほど、UPSのモニタで確認したところ、以下の稼働状況で、140W程度の消費電力でした。 Linuxが5つ、Windowsが1つ、HDD5台が動作している状況としては、大変満足のゆく環境ができました。 
- 公開サーバー
- 内部用ファイルサーバー
- REGZA用録画・再生DISK
- 家族用クライアント
- USB光アウトのMusicサーバー(トランスポーター)
- モデム・ブロードバンドルーターその他周辺機器